(一) 中草藥科技組
1.整合院內從事天然物、中草藥相關研究之教師組成研究團隊，使研究資源發揮最大利用率，建立本院在天然物、科技中草藥的基礎與應用的研究能量。
2.以天然物及中草藥的研究成果，鏈結藥理活性、合成化學、產品開發等領域，形成學術研究鏈，建立本院在學術與產業研究的特色。
3.負責本中心行政資訊之彙整與蒐集，同時也提供有關天然物於民生、醫療及研究各方面之資訊，提供於校內、外之諮詢為主要工作。
(二) 食品科技組
1.生物資源（天然物、中草藥、保養品與保健食品及高屏地區農特產品）機能性及保健活性成分之抽取、篩選、分離、鑑定及分析檢測技術研發。
2.生物資源（天然物、中草藥、保養品與保健食品、生物科技產品及高屏地區農特產品）之原料、分離粗抽取物及純化活性成分之藥理、毒理（含生物毒性）、保健功能技術篩選與建立。
3.生物資源新產品開發與應用，包括：（1）化妝品研發上之應用；（2）保養品與保健品之技術研發。
(三) 生技化妝品組
1. 研發與利用生物資源化妝產品。
2. 加強產學合作，研究與提供化妝品檢測分析技術。
3. 提供化妝品檢測分析技術訓練，落實產學成果於人才培育及教學。
